Selon de nouvelles recherches, le calcaire n’est pas seulement important dans l’industrie du ciment, mais il sert également d’archive pour la colonisation microbienne du sous-sol.
Des scientifiques de l’université Friedrich Schiller de Jena ont examiné des carottes de forage jusqu’à 300 mètres de profondeur dans le bassin de Thuringe pour mieux comprendre la biomasse des roches solides et l’état métabolique des microbiomes rocheux. Leur objectif ultime était de déchiffrer l’information génétique des micro-organismes présents dans les pierres et de les classer tant sur le plan taxonomique que fonctionnel.
« Sur la base des résultats de recherches antérieures, nous avons supposé que la teneur élevée en calcium du calcaire pouvait préserver l’ADN des micro-organismes, à l’instar du tartre dentaire des momies ou des squelettes. Cependant, en raison de la faible biomasse de la roche, les méthodes existantes ont dû être adaptées », a déclaré Carl-Eric Wegner, auteur principal de l’étude qui présente les nouveaux résultats, dans un communiqué aux médias.
Pour extraire l’ADN contenu dans les échantillons de roche en vue d’une analyse métagénomique, Wegner et ses collègues ont adapté des méthodes issues de l’archéologie microbienne et de la paléogénomique.
« Nous avons pu détecter des informations génétiques provenant de communautés microbiennes passées – appelées paléomes – dans trois échantillons de roche », a déclaré Kirsten Küsel, co-auteur de l’étude. « Ceux-ci nous donnent des informations sur les performances métaboliques qui jouaient un rôle lorsque ces micro-organismes étaient encore vivants. »
Sur la base de leurs découvertes, les chercheurs concluent que l’étude du calcaire est particulièrement adaptée car ses propriétés favorisent la préservation à long terme de l’information génétique.
« Déterminer l’âge de l’ADN endolithique est la clé de l’histoire géomicrobiologique du sous-sol », a déclaré Küsel.
Le scientifique a souligné que cette étude est cruciale pour comprendre le rôle des micro-organismes dans les cycles biogéochimiques, car on sait peu de choses à leur sujet, car la majeure partie de la biomasse microbienne de la Terre est cachée à des profondeurs allant jusqu’à cinq kilomètres sous la surface continentale, où les micro-organismes colonisent également. rocher solide.